財團法人醫院評鑑暨醫療品質策進會（以下簡稱醫策會）自2000年起開始辦理「醫療品質獎」，其前身為「醫品圈發表暨競賽活動」及「全面醫療品質提升競賽活動」。最初以「醫品圈」為推動重點（「醫品圈」為醫療機構品管圈之簡稱，英文全名為Healthcare Quality Improvement Circle，簡稱HQIC），鼓勵基層醫療人員組成團隊，選定品質改善的主題，以PDCA管理循環為基礎，利用團隊成員自我啟發與相互啟發、團隊合作、善用統計數據及品管工具進行持續性的改善活動。2002年（第3屆）起，基於品質提升工作應廣納多元品管手法的概念下，增設「品質改善組」徵求非醫品圈之品質改善專案參與競賽。2006年（第7屆）為擴大活動參與層面及鼓勵醫療界打破單位內或專業領域的本位主義，將活動名稱更改為「全面醫療品質提升競賽活動」，推廣「整合性全人醫療照護」及「病人安全」、「實證醫學」等相關議題。
2007年（第8屆）起，為使醫療機構重視多元化、系統化及實證基礎的改善觀念，將競賽架構重整，分為「主題類」、「系統類」及「實證醫學類」等三大競賽類別；並於2008年（第9屆）起將活動名稱改為「醫療品質獎」，英文全名為Healthcare Quality Improvement Campaign（維持簡稱為HQIC），期延續原活動簡稱以及對醫療品質提升的「持續改善」、「管理循環」及「團隊運作」之精神。
為鼓勵總床數99床（含）以下之醫療機構、診所、衛生所及長期照護等機構參賽，2011年（第12屆）起主題類增設「社區醫療照護組」。2013年（第14屆），為加強醫療團隊的合作與溝通技巧，並鼓勵醫療機構運用擬真訓練進行相關教育，新增「擬真情境類」競賽。2014年（第15屆）為提升醫療機構資訊科技之運用，新增「智慧醫療類」競賽，為鼓勵醫學生和住院醫師對實證醫學方法的熟悉度，實證醫學類重設「文獻查證新人組」。
為提升之參賽機構榮譽感，主題類類進階組於2014年（第15屆）全面提升獎項名稱；2015年（第16屆），各類競賽項下之「進階組」皆改為「菁英組」；2016年（第17屆）系統類更改競賽架構，增加卓越中心及卓越社區機構組，智慧醫療類「智慧醫院組」更名「醫療機構組」，並重新歸類競賽領域，期望有更多優秀團隊踴躍參與競賽。